Ninjago ha estat en pau des que els ninjas van vèncer a Ronin, però, quan un desaparegut senyor de la guerra torna per reclamar la pedra dels elements, els ninjes han d’unir-se amb Sensei, Samurai, dracs i lluitadors elementals per combatre els bruixots, guerrers fantasmes i la misteriosa lliga dels ninjes silenciosos.